《华盛顿邮报》27日报道称，潘建伟在今年夏天发给该报的邮件中就已对类似指控做过澄清。他在邮件中表示，自己和团队并没有协助中国军方发展量子技术。而中科大和中国电子科技集团的合作只涉及人才培养和科学咨询，这对于大学来说，是很正常的事情。潘建伟还就他接受中船重工邀请担任该公司“科技诿副主任”一事表示，这个职务职责是给中船重工的人员进行量子物理科普。潘建伟还反问说，如果这就算服务于军事项目，那么他今年3月还曾接受美国能源部邀请在美国一个会议上分享过中国量子物理的发展资讯呢，“这算不算服务于美国军队？”
据了解，潘建伟团队和美国路易斯安那州立大学、加拿大卡尔加里大学、德国海德堡大学等高校保持交流与合作，这些院校每年都有物理学家前往中科大上海研究院与潘建伟的研究团队进行学术交流。德国海德堡大学对《华盛顿邮报》表示，没有证据表明在海德堡大学进行的科学研究或是与中科大进行的合作研究成果，直接或间接地促成了中国军事能力的发展。
不过，潘建伟所遭受的这番指控，还不是这篇报告最恶毒之处。因为该报告还将中科大24名物理学者的名字，他们曾经留学过的外国学府，以及与他们有合作的西方学者，都统统罗列了出来。这不得不让人担心，此举是不是为了方便美国及其盟友的情报部门，还有一些它们的“喉舌”媒体，对这些科学家进行骚扰与迫害？
有中国学术界的知情人士告诉《环球时报》记者，美国通过这类套路对中国学者以及与中国学者有合作的外国学术机构进行打压和骚扰，早已是常态。这迫使一些科学家和科研机构不愿过多接受媒体采访等，因为一句很普通的话，都可能被美国的情报部门以及配合这些情报部门的媒体或是“白手套”机构歪曲，成为污蔑指控甚至迫害你的“借口”。